Naofumi Iwatani es un joven otaku universitario al que invocan a otro mundo como uno de los cuatro héroes elegidos, aunque para su desgracia, es el héroe menos poderoso de todos. Esto no desanima a Naofumi, quien espera poder apoyar a sus compañeros con su habilidad y confiar en el resto de héroes...

Naofumi cede a las proposiciones del vendedor de esclavos y compra a una joven semihumana con la esperanza de entrenarla y usarla para derrotar a enemigos y así subir de nivel.

La primera de las nuevas Olas se aproxima y Naofumi sigue entrenando con Raphtalia, quien ya se ha convertido en una espada bastante diestra. Pese a la situación de peligro, la relación del héroe del escudo con el resto de héroes no ha cambiado, al igual que tampoco su fama.

La ola se ha ido, pero el alivio de Naofumi dura poco, ya que Motoyasu lo reta a un duelo en medio del banquete de celebración en el castillo de Melromarc. Motoyasu insiste en que poseer un esclavo es impropio de un héroe y que Naofumi libere a Raphtalia de inmediato.

La actuación de Naofumi con la última ola hace que se granjee el aprecio del pueblo que salvó, pero eso no importa demasiado al rey, a Motoyasu o a la pérfida Malty. Intentando conseguir algo de ayuda para Raphtalia, Motoyasu acaba comprando un huevo de monstruo con la intención de criarlo.

Ahora que Filo ha aprendido a convertirse en niña humana, Naofumi busca algo de ropa que pueda servirle aun cuando se transforme y de paso encuentra una nueva forma de hacer dinero que le llevará a un resultado inesperado.

Naofumi sigue una petición de su amigo el comerciante para ir a un pueblo donde necesitan muchos herbicidas, algo que él puede fabricar (y vender) en grandes cantidades. Cuando llega descubre que los problemas allí presentes tienen algo que ver con cierto conocido. Mientras tanto, Raphtalia comienza a preocuparse por el hecho de que Naofumi preste más atención a Filo que a ella.

Cuando Naofumi llega a un pueblo aquejado por una enfermedad, su dura labor como vendedor de medicinas se complicará al aceptar una misión para acabar con el origen de la misma de una vez por todas.

Cuando el trío protagonista encuentra a una niña perdida en el bosque que parece amar a los filolial, Filo hace buenas migas con ella, pero ¿qué hace sola?

La siguiente ola se acerca y Naofumi intenta preparar una estrategia con Filo y Raphtalia, pero antes descubre cierta cosa que debe hacer y puede beneficiarlos.

Llega una nueva ola y Naofumi se prepara para proteger a la gente mientras el resto de héroes se preocupan solo por sus intereses, pero un duro enemigo puede que cambie cómo ven todos las cosas.

Una mujer llamada Glass se presenta ante Naofumi y el resto de héroes como la verdadera batalla de la ola. ¿Qué son las olas en realidad? ¿Y qué interés despertará el poder de Naofumi en el reino?

Tras el ataque a Melty, esta decide quedarse con Naofumi buscando su protección, pero entonces el héroe del escudo es acusado nuevamente de algo que no ha hecho: de secuestra a la princesa.

Huyendo de la primera princesa, Naofumi y su grupo llegan a una región repleta de semihumanos donde un noble que conoce Melty podría darles una mano.

Raphtalia arrinconta a Idol con venganza en sus ojos, apuntando su espada a la garganta del enemigo. Las palabras de Naofumi hacen que recobre el sentido, pero es entonces cuando Idol la ataca nuevamente...

El monstruo que libera Keel para acabar con Naofumi y su grupo es demasiado poderoso como para combatirlo en la ciudad, así que el primer paso es alejarlo de la zona. El problema es que es un enemigo formidable y recurrir al escudo de la ira podría ser la única salvación posible.

Fitoria quiere que Naofumi se reconcilie con el resto de héroes, porque si no lo hace, será más sencillo que mate a los cuatro héroes e invoquen a unos nuevos. Si no pueden reconciliarse como él dice, tendrá que poner a Filo a prueba para que demuestre que podrán sobrevivir a las olas.

Queriendo hacer honor a su promesa con Fitoria, Naofumi se dirige a un paso fronterizo donde se encontrará con alguno de los héroes para intentar pactar una tregua y comenzar desde cero, pero quien se encuentra es la peor opción de todas.

Motoyasu parece haber comprendido que Naofumi no es culpable de nada de lo que fue acusado, aunque la ira que alberga por la muerte de Itsuki y Ren todavía le ciega brevemente. La verdad sobre la Iglesia de los Tres Héroes comienza a salir a la luz.

Con Naofumi y el resto de héroes formando equipo, el objetivo es derrotar al malvado pontífice, pero es demasiado poderoso como para lograrlo por métodos normales.

La reina lleva a Naofumi a la capital y pretende limpiar su nombre públicamente, aunque para ello tenga que hundir en la miseria a los responsables de todo lo ocurrido.

Con el reino cambiando finalmente, la reina reúne a los cuatro héroes para hacerlos hablar, compartir información y colaborar si quieren sobrevivir a la próxima ola.

Nuestros protagonistas se acercan a la isla en la que esperan poder subir de nivel de forma más conveniente, pero el par de pasajeros del barco en el que viajan les hacen cierta propuesta.

Tras detectar la proximidad de una nueva ola cercana a Cal Mira, Naofumi y el resto piden ayuda a la reina para prepararse para lo que probablemente sea un combate en alta mar. Será allí donde Naofumi se lleve una sorpresa con respecto a alguien.

Naofumi debe lidiar con Glass, L'Arc y Therese si quiere proteger el mundo y acabar con la ola, pero ¿no es eso lo que buscan también los héroes del otro mundo? ¿Es correcto condenar un mundo para salvar el mundo que lo trató tan mal?

Una nueva amenaza se cierne sobre el mundo con el despertar del espíritu tortuga y sus efectos pueden ser igual de destructivos o más que las Olas

Naofumi se lanza al ataque con sus compañeras y la ayuda de Ost, pero el enemigo es extremadamente poderoso. ¿Quién controla al espíritu tortuga?

La Tortuga Espiritual comienza su marcha una vez más, apareciendo en la frontera del reino que lleva su nombre. Naofumi se ofrece como voluntario para atraer a sus familiares mientras el ejército intenta llevarlo a las montañas. El familiar de la Tortuga Espiritual, Ost, lucha junto a los humanos...

Naofumi y su grupo, junto con Ost, suben al espíritu tortuga buscando la forma de detenerlo, pero la conclusión es clara: han de entrar en su cuerpo.

El grupo de Naofumi se encuentra con unos viejos conocidos, concretamente con Arc, Therese y Glass. ¿Qué buscan en su mundo estos héroes de otro mundo? ¿Qué interés tienen en el espíritu tortuga? Pronto descubrirán algo más sobre quién es el responsable de lo que está sucediendo.

El interior del espíritu tortuga se convierte en un campo de batalla y parece que acabar con él no va a ser tan sencillo, pero ahora que el grupo de Naofumi ha descubierto la verdad sobre Ost...

Naofumi y su grupo han acabado al otro lado del portal y parece un mundo diferente. Allí encuentran a alguien encerrado que parece conocer a L'Arc y compañía.

Naofumi, Kizuna, Raphtalia y Liscia regresan finalmente al mundo al que fueron transportados. Naofumi quiere continuar la búsqueda de Filo, pero primero el grupo tiene que equiparse y ponerse a salvo.

Naofumi, Liscia y Kizuna han sido teletransportados, dejando a Raphtalia en manos del enemigo contra su voluntad. El héroe con el escudo ahora no quiere perder ni un minuto para encontrar a sus compañeros.

Raphtalia está recluida en prisión, en Rayble. Allí encuentra a Lark, Glass y Tellis, también encerrados. Los antiguos enemigos tendrán que cooperar si esperan escapar de este lugar maldito.

El grupo se une a Lark, Tellis y Glass, que por fin se reúnen con Kizuna tras años de separación. La siguiente ola se acerca, pero los héroes de cada mundo aún deben enfrentarse a Kyo.

Una Ola ocurre mucho antes de lo previsto y todo indica que Kyo es el responsable. Ahora, Naofumi y sus compañeros deben acudir al Héroe del Libro, mientras Kizuna y los demás héroes de este mundo luchan por salvar su hogar.

Raphtalia narra la elección de ropa con sus compañeros cuando tuvo que comprarse nueva al haberse hecho más pequeña. Kizuna recuerda cuando estuvo sola durante mucho tiempo en el Laberinto. Rishia rememora a Ost intentando dar consejos “delicados”... sin mucho acierto.

Naofumi necesita reforzar su territorio antes de que resucite el Fénix, en especial cuando descubre que los otros tres héroes han desaparecido. Para ello decide comprar a todos los esclavos que encuentre que procedan de la aldea Lurolona, lo que lo llevará a un viaje a un país vecino.

Naofumi y sus compañeras avanzan en los combates del coliseo, aunque una mujer llamada Nadia se acerca a nuestro protagonista y le da cierto consejo: que se retire.

Naofumi acude a comprar a un esclavo muy especial, un habitante de su aldea injustamente secuestrado y vendido.

Naofumi parte por orden de la reina a buscar al resto de héroes, y del primero del que tienen información es de Momoyasu, el héroe de la lanza.

Tras el encuentro con Motoyasu, Naofumi y los suyos se ven envueltos en problemas con unos atacantes y S'yne está involucrada. ¿Puede confiar Naofumi en ella?

Ren se ha convertido en un bandido, pero Naofumi no tarda en descubrir qué sucede realmente.

Mientras Naofumi sigue esforzándose por reforzar las defensas y prepararse para la llegada del fénix, la reina le envía una alquimista algo particular que puede serle de ayuda. También reciben otro peculiar invitado: un huevo de dragón.

Naofumi y compañía parten a detener al dragón, pero no tardarán en descubrir que al tragarse el núcleo del dragón zombi al que el Héroe del Escudo venció tiempo atrás, ha regresado al que era su nido. Y los problemas no terminan ahí.

El grupo se prepara para enfrentarse al emperador dragón y hacerlo caer, tanto para salvarse ellos mismos como para salvar a Filo.

A Naofumi y el resto de su grupo le llegan noticias de que en el coliseo hay alguien con un parecido más que sospechoso con Itsuki.

Itsuki parece haber perdido la cabeza completamente y cree que su justicia es la única válida, a lo que Rishia, Naofumi y el resto intentarán poner remedio.

El nuevo equipo para Raphtalia desencadena que sepamos más de su pasado y crea nuevos problemas a Naofumi y al resto.