Tras sufrir una tragedia personal, Bryan Mills se embarca en una visión de venganza para acabar con el implacable jefe de un cártel. Mientras tanto, un equipo de inteligencia encubierto norteamericano, dirigido por Christina Hart, recluta a Bryan como agente.

Apartado durante semanas, Bryan por fin tiene una oportunidad para actuar sobre el terreno. La misión revela una siniestra conspiración en torno a la muerte de un agente gubernamental. Mientras, Hart contacta con un hombre de su pasado.

Bryan y el equipo buscan a un presunto terrorista secuestrado, lo que les lleva a descubrir una conspiración aún mayor dentro del propio gobierno. Christina recibe una noticia perturbadora y recurre a Harry en busca de apoyo. A Asha le preocupa la fijación de Bryan con Mejía.

La insistencia de Riley en descubrir la verdad tras un fármaco letal administrado a los veteranos de guerra hace que secuestren a la hija de uno de sus contactos. Alguien se cuela en el apartamento de Asha, pero una vecina nueva la tranquiliza.

Christina ordena que se recuperen unos documentos comprometidos que hay en Zúrich y que son necesarios para evitar un desastre político y económico.

A Inteligencia Nacional le piden que ayude a un agente del Servicio Federal de Seguridad ruso a que deserte, pero su novia embarazada pondrá en peligro los planes del equipo. Mientras, Christina se salta las reglas para destapar a un topo en la CIA, y el intento de John para solucionar el problema de su hermano con unos pandilleros termina en crisis espiritual.

Durante los esfuerzos del equipo para frustrar una operación de armas de Mejía, Bryan es tomado. A medida que se basa en su entrenamiento ODNI para sobrevivir, el equipo intenta un rescate audaz. Mientras tanto, Bryan y Asha llevan su relación al siguiente nivel.

Inteligencia Nacional ayuda a una espía israelí con alzhéimer temprano y a quien su propia agencia quiere ver muerta. Christina teme que su destino sea el mismo a la vez que se ve amenazada por fuerzas de su propia organización, y la desconfianza de Bryan hacia Asha desemboca en una dolorosa discusión.

Inteligencia Nacional se ve obligada a entregar a Mejía (aparición especial de Romano Ozari) al FBI, pero se entera de los planes del cártel de interceptar el traslado.

Cuando el FBI amenaza con apartar a Christina del mando, Bryan y John emprenden una misión por su cuenta para detener a los socios de Mejía antes de que crucen la frontera. Sin aliados que puedan ayudar, Inteligencia Nacional se juega perder el trabajo, la vida y a sus seres queridos.

Después de que Bryan Mills desafiara las órdenes de su jefe, Christina Hart, para vengarse del hombre que mató a su hermana, en el estreno de la segunda temporada encontramos a Bryan luchando por sobrevivir en una cárcel mexicana clandestina.

Después de que se estrelle un avión en el que viajaban Bryan Mills y un testigo clave en una investigación de asesinato, Mills resulta herido y debe recurrir a las habilidades que su padre le enseñó para sobrevivir a la situación.

Un trabajador despedido secuestra a un contable de alto nivel como venganza por la pensión que ha perdido, y el equipo se ve envuelto en un caso de lucha de clases cuando Bryan decide ayudar al secuestrador a hacer justicia.

Cuando alguien roba el «maletín nuclear» presidencial, Bryan y el equipo deben recuperarlo antes de que las medidas confidenciales de seguridad nacional caigan en manos peligrosas.

Santana se ve obligada a afrontar su pasado cuando es secuestrado un diplomático extranjero relacionado con el tráfico sexual.

Cuando secuestran a la esposa de un senador y héroe de guerra, Bryan y el equipo deben averiguar si su desaparición ha sido obra de un gobierno extranjero o de alguien mucho más cercano.

Bryan y Santana deben rescatar a un físico nuclear, dado por muerto durante mucho tiempo, de una cárcel secreta en Corea del Norte.

Hart emprende una misión en solitario en busca del mentor que la traicionó y el equipo intenta localizarla antes de que sea demasiado tarde.

Hart debe encontrar la manera de impedir a un experiodista exiliado que filtre los nombres de agentes gubernamentales antes de que se pierdan vidas inocentes.

Después de que se produzca un robo de especies invasivas en el Banco Mundial de Semillas de Noruega, Bryan tiene que impedir un ataque terrorista biológico.

Cuando se produce la explosión de una bomba en Washington D.C., el equipo sospecha que se está culpando a una persona inocente.

Cuando un peligroso traficante de armas introduce su mercancía en la ciudad de Nueva York, Bryan colabora con el FBI en una carrera contrarreloj para detenerlo antes de que se ponga a salvo en aguas internacionales.

Tras el secuestro del hijo de un analista de la CIA, el equipo recibe ayuda de alguien inesperado: otra víctima de secuestro.

Bryan tiene que proteger a su primo de una poderosa organización mafiosa.

La hija de un funcionario gubernamental que trabaja en el extranjero es secuestrada y un sospechoso inesperado frustra la operación de rescate de Bryan.

Con Hart en grave peligro, el equipo debe encontrar la manera de detener a Ramsey antes de que su plan de asesinar a un senador provoque una guerra contra terroristas internacionales.