Действие происходит в ближайшем будущем. Уилл и Кейти Боуман переживают личную трагедию — воздвигнутая инопланетными захватчиками стена разделила их с одним из сыновей. Внезапно Уиллу предоставляется шанс вернуть мальчика, но для этого придется сделать непростой выбор — остаться верным своим убеждениям или начать работать на врага.

Уилл сталкивается с непредвиденными трудностями во время своего первого дня на новой работе. Кэти получает свое первое задание. Мэдди встречается со старым знакомым, а Карлос платит свою цену за сотрудничество с Уиллом.

Первая миссия Кейт заставляет её сомневаться в преданности делу. Сопротивление не поддерживает Уилла в его поисках Джеронимо, а девушка Брэма делится с ним тайной.

Уилл продолжает зарабатывать уважение своих новых коллег, но когда его дом оказывается в опасности, все оказываются под подозрением - даже самые близкие люди. В это время, Мэдди находит путь в высший эшелон.

Личность Джеронимо раскрывается; Уилл начинает сомневаться в преданности Кэти, а Брэм находит свой путь в таинственный мир. Снайдер получает возможность улучшить свое положение.

Вследствие операции сопротивления Уилл, Кэйти и Снайдер застревают в Йонке, и проверяется на чьей они стороне.

Уилл охотиться за членами сопротивления, что приближает его к разгадке тайны его жены. Кэти чувствует себя оторванной от своей семьи, а Мэдди оказывается в центре интриг в Зеленой Зоне.

Высокопоставленный участник Сопротивления готов заключить сделку. Кэйти получает второй шанс, а Брэм собирается на опасную вылазку за пределы колонии.

Уилл хочет, чтобы его семья избавилась от оккупации; Кейт и Бруссард планируют сложную операцию; Снайдер пытается защитить свой офис, а Мэдди делает важный политический шаг.

Сопротивление похищает персону очень важного значения. Блок Лос-Анджелеса отправляют в жесткую изоляцию.

Уилл и Кэти делают попытки сохранить свою семью в меняющемся городе; Брассард возвращается домой; Снайдер получает предложение о работе от таинственной организации.

Уилл решает довериться старому другу. Дженнифер посещает Кэти в то время, как Брэм встречает коменданта лагеря.

Уилл, Девон, и Чарли пытаются вернуться домой. Кэти, которая боится худшего, прощается с дочерью. Брэм находит друзей в лагере; а Мэдди находит новый проект.

Дженнифер наблюдает за домом Баумена; когда Чарли возвращается домой, семья сталкивается с неожиданными проблемами.

Уилл возвращается в незнакомое место; Кэти на ее лучшем поведении; Брауссард и его ячейка делают открытие о стене.

Сопротивление тянется к Кейти; Уилл хочет помочь своей жене похоронить свое прошлое; Мэдди и Нолан посещают трудовой лагерь.

Брэм пускается в рискованную диверсионную миссию со своими друзьями; Уилл сталкивается с новым сопротивлением; Кейт узнает темную правду о блоке.

Уилл и Кэти должны спасти беглеца от оккупации; в лагере Снайдер скрывает доказательства; ячейка Бруссарда находится под угрозой одного из своих собственных членов.

Уилл и Кэти пытаются вступить в контакт с новым прибывшим в блок; У Боба есть несколько вопросов для семьи Бауман.

Уилл, Кэти и Брауссард ищут выход из колонии; у Мэдди некоторые посетители в зеленой зоне; Брэм ищет как избавиться.

Атака на зеленую зону, одна из пяти различных точек зрения.

Уилл, Кэти, Брауссард борятся с Красной Рукой. Снайдер помогает Хелене восстановить контроль над блоком Лос-Анджелеса.

В финале второго сезона семья Бауменов сталкивается с самым сложным решением в их жизни, после того, как узнает, какая судьба ждет колонию.

Спустя шесть месяцев после побега из Лос-Анджелеса, семья Боумэна и Снайдер наслаждаются простой жизнью в горах, пока внезапное прибытие не изменит все.

Уилл и Кэти рискуют вступить в контакт с Сопротивлением. Бруссард, оставшийся в Лос-Анжелесе, собирает пазлы из разрезанных секретных документов и помогает выбраться застену чудом выжившим жителям.

Уилл оценивает безопасность лагеря Сопротивления. Кэти хочет быть более вовлеченной. Бруссард и Эми находят выживших за пределами стены.

Уилл и Кэти опасаются, что они могут оказаться в опасности, когда лагерь сопротивления будет помещен в изоляцию; рискованный план заставляет Бруссар сомневаться в намерениях Эми.

Уилл, Кэти и Снайдер будут бороться за свои тайны, находясь на допросе.

Решение Уилла избегать колоний меняется, когда последствия ранения Грэйси начинают угрожать ее жизни. Боуманам приходится пойти на крайность и рискнуть собственной безопасностью, чтобы спасти дочь. Тем временем Голдвин всеми способами пытается склонить наслаждающегося заслуженными привилегиями Снайдера к новому сотрудничеству, но после того, как тот все же поддается на уговоры Хелены помочь ей с ее карьерой, женщину ждет сюрприз в виде нестандартного подхода, примененного Аланом для достижения цели.

Обосновавшись в колонии, Боуманы начинают отдаляться друг от друга – Уилл, работающий таксистом и неофициально расследующий исчезновения людей, по-прежнему считает, что его семье здесь не место, тогда как нашедшая себя в работе консультантом миграционной службы Кейти хочет дать системе еще один шанс. Однако чрезмерные старания женщины помочь нуждающимся внезапно открывают ей жестокую правду об этом месте, в то время как ее муж раскрывает непростое дело и встречается со старым знакомым.

Приняв предложение Бруссарда, Уилл соглашается проследить за курьером, способным вывести их на тщательно охраняемые секретные объекты в черте города. Однако план по захвату мужчины едва не проваливается, когда Боуман неожиданно бросает напарников ради более важной цели. Тем временем Кейти продолжает свое расследование и приходит к неутешительным выводам по поводу судьбы некоторых беженцев. Брэм же начинает строить карьеру ради будущего своей семьи, а Снайдер наносит визит Кайнсу и узнает о технологиях, позволивших Сиэтлу стать самой процветающей среди колоний.

Горя желанием расправиться со Снайдером за его предательство и произошедшую по его вине трагедию, Уилл с сыном присоединяются к операции Бруссарда и Эми, планирующих взять Алана в плен и выпытать у того сведения о секретных разработках на острове. Между тем Кайнс, узнав о желании гостя задержаться в Сиэтле на несколько дней, приставляет к нему телохранителей. Боуману же предстоит переосмыслить свои мотивы, а также сделать печальное открытие по поводу намерений Брэма.

Узнав о решении Бруссарда и дальше сотрудничать с Боуманом, Эми отказывается участвовать в новых операциях. Тем временем Уилл делится с супругой всем, что узнал от Снайдера, и Кейти, включившись в расследование происходящего, узнает много нового о заботливо собираемых Кайнсом людях, в число которых входит и ее муж. Алан же, заручившись поддержкой единомышленника, начинает выяснять, что именно задумал Эверетт, и вскоре поиски мужчины дают первые результаты.

Снайдер создает прецедент, чтобы ИГП могло беспрепятственно заниматься поверкой всех тайных операций в Сиэтле, в то время как Кайнс сообщает прибывшей Хелене, порочащие ее подчиненного, сведения, и параллельно запускает протокол, подготовленный специально для такого случая. Между тем Бруссард с Уиллом и Кейти встречаются с ячейкой сопротивления, сотрудничество с членами которой раскрывает им глаза на замысел главы колонии, а Алана ждет новое, не особо радующее его назначение.

Снайдер создает прецедент, чтобы ИГП могло беспрепятственно заниматься поверкой всех тайных операций в Сиэтле, в то время как Кайнс сообщает прибывшей Хелене, порочащие ее подчиненного, сведения, и параллельно запускает протокол, подготовленный специально для такого случая. Между тем Бруссард с Уиллом и Кейти встречаются с ячейкой сопротивления, сотрудничество с членами которой раскрывает им глаза на замысел главы колонии, а Алана ждет новое, не особо радующее его назначение.

Несмотря на попытки Кейти поговорить с сыном, Брэм ясно дает понять матери, на какой он стороне. Узнавший о нападении на Землю Снайдер пытается заручиться поддержкой задержанного Уилла для защиты колонии. Бруссарду же приходится взять командование повстанцами на себя, в ходе чего его, как и Боумана, ждут нерадостные вести, которые они озвучивают остальным отправникам. Кейти, между тем, использует единственную зацепку, чтобы отыскать Грэйси, а Алан доносит до членов бывшего совета Кайнса информацию о реальном положении дел.