Cuando la teniente Sonya Blade llama en un informe que ha rastreado a Kano, "Jax" Briggs convence a su superior, Kurtis Stryker, para que atrape a un escuadrón de hombres, solo para descubrir que es una trampa.

Mientras Jax y Kano luchan hasta la muerte, Sonya logra escapar de sus ataduras. Sin embargo, Jax se ve obligada a protegerla de una explosión, hiriendo a ambos.

Johnny Cage, ex Power Ranger, intenta reiniciar su carrera como estrella de acción solo para descubrir que nadie quiere un actor adolescente agotado. Pero cuando los ejecutivos de la televisión lo presionan demasiado, Johnny se vuelve loco ... y recibe una oferta que no puede rechazar.

Hermosas, atléticas y entrenadas como asesinas altamente capacitadas, Kitana y Mileena crecieron pensando que son hermanas. Shao Kahn, Emperador del Outworld, ha engañado a Shang Tsung para que se convierta en su sirviente de Mortal Kombat haciéndole clonar a Mileena como un clon de Kitana en Tarkatan, por el temor de Shao Kahn de que Kitana no lo amaría lo suficiente si alguna vez se enterara de la La verdad sobre su madre y su padre.

La rivalidad entre Kitana y Mileena crece, mientras que Kitana intenta aprender la verdad detrás de su infancia y la verdadera identidad de sus padres.

Raiden cae a la tierra y se limita a un hospital psiquiátrico. Con el tiempo agotándose antes del comienzo del torneo de Mortal Kombat, su única esperanza para escapar es con su compañero paciente, Anna Blue.

En el Japón feudal, el guerrero más grande, el general Hanzo Hasashi del Shirai Ryu, entrena a regañadientes a su hijo en los caminos de batalla. Sin embargo, cuando llega el Shogun, Hanzo descubre que los enemigos de su Ryu han tendido una trampa.

Con el clan Shirai Ryu asesinado por las manos de Sub-Zero y Lin Kuei, Hanzo Hasashi no ha protegido a su aldea. Con su alma eterna destinada a pudrirse en las profundidades del infierno, es visitado por un misterioso hechicero. ¿Será suficiente la venganza para que Scorpion entre al Torneo Mortal Kombat?

Cyrax y Sektor son elegidos para ser el futuro de Lin Kuei por el Gran Maestro, pero Cyrax no está tan entusiasmado con entregar su vida a una transformación cibernética que borrará sus recuerdos y lo convertirá en la máquina de combate definitiva. Cuando descubre que el cyborg con el que está luchando parece muy familiar, Sektor debe mantener a Cyrax enfocado en destruir a Hydro, y no a él mismo ni a su futuro ...

En un bar de karaoke en Macao, dos viejos amigos renuevan su relación ... aunque uno no quiere hacerlo.

El torneo comienza cuando Raiden convoca a sus aliados y Shang Tsung llega con los suyos.

Mientras Raiden informa a los guerreros del Reino de la Tierra qué esperar, Kenshi recuerda su batalla por la Espada de Sento contra el demonio Ermac.

En la primera pelea del torneo Mortal Kombat, Kenshi lucha contra su antiguo enemigo Ermac hasta la muerte.

Kitana cuestiona todo lo que sabe después de descubrir a su verdadero padre. Sin embargo, Shao Khan le ordena a ella y a su hermana que participen en el torneo para competir por Outworld, y se encuentran con Johnny Cage.

Kitana debe elegir a quién servirá cuando Mileena pelee hasta la muerte con Johnny Cage.

En el Japón feudal, Hanzo y Bi Han intentan resolver la antigua enemistad entre sus dos clanes, a pesar de los esfuerzos del resentido hermano de Bi Han, Kuai Lang.

Sub Zero descubre demasiado tarde que su amigo de la infancia, Hanzo, lo responsabiliza por la muerte de su familia y su aldea.

Después de la muerte de la prometida de Liu Kang, el hechicero Shang Tsung se acerca al artista marcial y le ofrece venganza contra todos los criminales del Reino de la Tierra ... si Liu luchará por Outworld en el torneo Mortal Kombat.

Kung Lao descubre que Liu ahora está trabajando para Shang Tsung y Outworld, y se niega a pelear con su amigo ... que ya ha derrotado a Johnny y Stryker.