В «OsCorp» пожилой учёный Эдриан Тумс узнаёт о том, что Норман Озборн украл разработку Тумса для своей компании, и теперь Эдриан становится «Грифом» — супер-злодеем, использующим специальное устройство, позволяющее ему летать и наделяющее особой защитой, чтобы отомстить ему. А вскоре, таинственный «Большой Босс» вызывает «Громил» (Инфорсеров) — банду Нью-Йоркских головорезов, специализирующихся на выполнении грязной работы для криминальных авторитетов города, чтобы уничтожить Человека-Паука, который срывает преступные планы «Босса».

История об Электро.

История о Ящере. Курт Коннорс пытался восстановить потерянную руку и ввёл себе ДНК ящерицы, но сам превратился в неё. Человек-паук всё-таки смог остановить его. При этом Питер сделал удачные фотки Паука, но потерял доверие друзей.

История о Шокере. Паркер из-за фотографий теряет доверие Гарри Озборна.

История о Песочном Человеке. Питер пробуется в команду по американскому футболу с Гарри. Гвен Стейси постепенно проявляет внимание к Питеру.

История о Носороге. Питер узнает личность «Большого Босса». Знакомимся с Мэри Джейн Уотсон.

История о Зелёном Гоблине.

История о Докторе Осьминоге. Постоянные изменения на фронте отношений.

Последнее сражение с Гоблином в этом сезоне, раскрытие его личины в виде Гарри. В конце земляне обнаруживают симбиот.

История о Хамелеоне. Питер обрел чёрный костюм.

Питер поймёт, что костюм — живой организм. Сражение со Зловещей шестёркой.

Внутренний конфликт Паркера. Он пытается избавиться от симбиота, и ему это удаётся.

История о Веноме. Симбиот соединяется с Эдди Броков. Возврат доверия друзей.

История о Мистерио. Питер определяется с девушкой. Находит работу.

История о Крэйвене Охотнике. Гвен или Лиз?

Паук вновь сталкивается со Зловещей шестёркой, на сей раз слегка обновлённой.

Человек-паук должен остановить Октопуса прежде, чем он захватит мир. Питер начинает встречаться с Лиз.

Возвращение Гарри.

Веном преследует Человека-Паука.

«Дэйли Бъюгл» ведёт расследование по поводу раскрытия второй личности Питера.

Человек-паук, Молотоглав, Сильверсейбл и Рино борются за устройство, позволяющие создавать клонов Рино.

Новые Инфорсеры (старые, но теперь не только Шокер обладает костюмом с суперспособностями) противостоят Пауку.

Томбстоун, Док Ок и Сильвермейн борются за контроль над городом. У Питера и других свидание.

История о Расплавленном Человеке.

Чёрная кошка пытается вызволить из тюрьмы своего отца, который являлся убийцей дяди Бэна.

Питер узнаёт, кто на самом деле скрывается под маской зелёного безумца — всё-таки это был Норман Озборн, который хитро всё подстроил, подставив даже сына. Налаживаются отношения с Гвен, однако им так и не удаётся быть вместе.