Спайк и Джет преследуют преступника, который контрабандой перевозит наркотик, усиливающий рефлексы.

Спайк и Джет отправляются на поиски Абдула Хакима, который украл "data dog" из исследовательского центра за вознаграждение в 8 миллионов вулонгов. Оказывается, что они не единственные, кто его преследует.

Спайк и Джет впервые встречают Фэй Валентайн в казино, которая вовлечена в аферу с боссом мафии в попытке списать свой огромный долг. Они обнаруживают, что Фэй более коварна, чем кажется на первый взгляд.

Спайк и Джет сражаются с Марией Мердок, лидером экстремальной группы борцов за права животных под названием "Космические воины".

Во время поисков Мао Енрая, руководителя Синдиката Красного Дракона, Спайк сталкивается с Вишесом, своим старым врагом.

Спайк и Джет преследуют опасного врага, который, несмотря на внешность маленького мальчика, генетически изменен из-за метеоритного дождя на Земле.

Спайк, Фэй и Джет охотятся за Декером, головорезом, у которого есть взрывчатка. Они встречают В.Т., женщину-космонавта, и объединяются с ней, чтобы поймать Декера во время опасной погони по заброшенной шахте.

Получив награду, Спайк обретает поклонника в лице Роко Боннаро. Роко, член мелкой банды, украл редкое и ценное растение у своей собственной банды. Спайк обнаруживает, что оно ценнее, чем он сам, но у Роко другой план на это растение.

Что-то вырезает гигантские рисунки на поверхности Земли, и земная полиция объявляет награду, привлекая Спайка и Джета. По слухам, виновником является талантливый компьютерный хакер Эдвард, но истина совсем другая.

Джет сталкивается со своим прошлым на Ганимеде, где любимая женщина, Алиса, покинула его, не попрощавшись. Спайк узнает о новой награде, которая связана с Алисой.

Таинственное нечто крадется по кораблю "Бибоп" и кусает членов экипажа, оставляя неприятные фиолетовые рубцы. В конце концов, Спайк остается один и должен спасти корабль.

Фэй исчезает со всеми деньгами на Бибопе. Эд пытается найти ее и обнаруживает на луне Юпитера Каллисто "Кодовое Имя Джулия", что заставляет Спайка поверить, что это его Джулия.

На Фэй нападают, а затем ей помогает Грен, который затаил обиду на Вишеса. Объяснив Фэй свою историю, он преследует Вишеса, и когда они со Спайком настигают его, происходит трехсторонняя битва.

Команда Бибопа расследует странную серию ограблений платной автостоянки "Гиперпространственные врата", каждое из которых совершено разными лицами, а организатор всего этого - Хекс.

Фэй рассказывает о своем пробуждении после криогенной заморозки и о человеке, Уитни Хагасе Мацумото, который помог ей перед смертью. Однако Джет прибывает на корабль, поймав его за вознаграждение. Теперь Фэй должна узнать, что было на самом деле.

Старый напарник Джета, полицейский, обращается к нему с просьбой остановить группу заключенных на захваченном транспортном корабле, с одним из которых у Джета личные счеты.

Корабль "Бибоп" терпит крушение на Луне после бокового столкновения в космосе. Эд и Айн отправляются на поиски пищи, но оказываются втянутыми в операции преступника, занимающегося контрабандой психоделических грибов.

Фэй приходит таинственная посылка с кассетой "Бета". Пока Фэй бежит, думая, что это от сборщика долгов, Джет и Спайк предпринимают трудные поиски плеера, чтобы просмотреть ее. Они обнаруживают, что это ключ к прошлому Фэй.

Спайк, отправив свой моноколесо на техобслуживание. Джет и Фэй сражаются с группой пиратов, которые используют компьютерные вирусы, чтобы терроризировать межпланетные перевозки.

Спайк становится свидетелем убийства, совершенного невменяемым серийным убийцей, который затем преследует его с полным шквалом оружия.

Джет получает таинственную записку от старого друга Пао и объединяется с его дочерью, которая использует Фэн-шуй для ее расшифровки. Их преследуют мафиози из синдиката, которые также ищут его.

Серийный террорист пытается взорвать небоскребы, но Спайка больше беспокоит ковбой в стиле американского вестерна на коне, который мешает его попыткам поймать наглеца.

За голову доктора Лондеса, лидера религиозного культа Скрэтч, назначена большая награда. Спайк выходит на улицы, чтобы добраться до него, а Джет и Эд покупают видеоигру, с помощью которой члены культа поднимаются в цифровое бытие.

Эд выставляет фальшивую награду за своего отца, надеясь, что Джет и Спайк приведут ее к нему. Так и происходит, и, несмотря на радостное воссоединение, отец тут же бросает ее, чтобы продолжить свою работу. Эд и Айн решают покинуть группу.

Фэй ненадолго объединяется с Джулией, когда помогает ей сбежать от отряда убийц Красного Дракона, и передает Спайку сообщение о местонахождении Джулии. Спайк и Джулия наконец-то встречаются.

Вишес претендует на лидерство в Синдикате Красного Дракона. Джулия и Спайк планируют сбежать, как и раньше, но Спайк все еще чувствует желание отомстить, что приводит к финальной конфронтации с Вишесом и Синдикатом. Фэй ненадолго объединяется с Джулией, когда помогает ей сбежать от отряда убийц Красного Дракона, и передает Спайку сообщение о местонахождении Джулии. Спайк и Джулия наконец-то воссоединяются.