Una mujer conoce a un vagabundo y le invita a alojarse en su dojo. Más tarde se dará cuenta de su verdadera identidad.

Kenshin y Kaoru se encuentran con un chico que se dedica a robar. Pronto descubrirán que trabaja para una mafia.

Le ofrecen un puesto de alto rango en el ejercito a Kenshin y deberá pensar si se une o no. Por otra parte Yahiko no está satisfecho con su entrenamiento

Gohei Hiruma en vengaza por ser derrotado por Kenshin contrata a un luchador para acabar con Kenshin.

Zanza quiere hacer pagar a Kenshin por su sufrimiento en el pasado. ¿Cómo terminará esto?

El gobierno contacta con Kenshin para que detenga a un asesino despiadado.

Kenshin se ve tentado de volver a ser el asesino que fue para salvar a Kaoru. ¿Podrá está impedirlo?

Sanosuke conoce a una misterios mujer que le pide ayuda para escapar de una banda

Megumi es forzada a volver bajo amenaza de hacer daño a Kanshin y sus amigos

La banda que persigue a Megumi hará lo que sea para traerla de vuelta

Kenshin se niega a matar a Aoshi en duelo y este se replantea sus propios valores

Yahiko se enamora de una chica que tiene problemas con unos matones e intentará ayudarla

Kaoru decide entrenar a un luchador de sumo llamado Toramaru.

Megumi, Kenshin y Sanosuke intentarán salvar la vida de una niña enferma.

Kenshin se enfrenta al escuadrón Jinpuu.

El escuadrón Jinpuu es derrotado.

Kenshin y sus amigos se enfrentan a un millonario corrupto.

Gohei Hiruma nuevamente quiere venganza y la espada de filo invertido de Kenshin.

La hermana del doctor Gensai le enseña al grupo la casa de un joven que busca a un maestro.

Kenshin es atacado por intentar frustrar los planes de Raijuta.

Kenshin se enfrenta a Raijuta que intenta matarlo.

Kenshin se ve envuelto en problemas en el transcurso de un viaje en tren.

Sanosuke convence a un pintor para que le ayude a derrotar a quien traicionó al Capitán Sagara

Kenshin intentará evitar que se forme un Ejército Imperial falso.

Kenshin y Kaoru son atacados por unos piratas.

Los piratas conspiran para derrocar a su lider, Shura. Kenshin intenta advertirla pero ella no le cree.

Shura tiene problemas y Kenshin intentará intervenir.

Kenshin comienza a tener sueños de su pasado como guerrero al servicio de los Isshin-Shishi y su enfrentamiento contra los Shinsengumi.

Reaparece Saito, el antiguo capitán del Shinsengumi.

Kenshin está a punto de volver a convertirse en Battousai mientras lucha contra Saito.

Kenshin viaja a Kioto para detener los planes de Shishio.

Kaoru y Sanosuke deciden seguir a Kanshin hasta Kioto a pesar de saber que pueden ser un lastre para él.

Aoshi quiere volver a desafiar a Kanshin para demostrar que es mejor que él.

Misao sigue a Kenshin con la esperanza de que este la conduzca hasta Aoshi.

Kenshin y Misao acompañan a Eiji hasta su pueblo donde se encontrarán con las tropas de Shishio.

Kenshin conoce a Shishio y este le cuenta sus planes para conquistar Japón. Kenshin se prepara para desafiarlo pero aparece Senkaku.

Shishio siente que Kenshin todavía no es digno de enfrentarse con él y encarga a Soujiro luchar con Kenshin.

Sanosuke conoce a un monje en el bosque y este le ensañe una nueva técnica.

Kenshin y Misao viajan a Kioto y visitan al hijo del maestro que forjó el filo inverso de Kenshin.

Kenshin se ve obligado a elegir si volver a matar o no para salvar a un bebé.

El antiguo maestro de Kenshin se niega a aceptarlo como alumno de nuevo.

Okina se entera de que Aoshi los traicionó y trabaja junto a Shishio, y lo desafía a un combate a muerte. Misao se entera de esto y sale a buscarlos para impedirlo.

Kenshin no es capaz de superar a su maestro y su desesperación lo lleva a convertirse en Battousai con tal de aprender una técnica letal.

Kenshin se marcha de la casa de su maestro mientras que en el templo de Shishio "las diez espadas" traman un plan para acabar con él.

Kenshin y Saito se reúnen dentro del cuartel y son avisados de que Shishio planea incendiar Kioto.

Sanosuke hunde la nave de Shishio con ayuda de su nueva técnica.

Llega el momento del combate final y Yumi Komagata se ofrece como escolta para guiar a Kenshin, Sanosuke y Saito.

Sanosuke se enfrenta contra Anji y le hace ver que vender su alma no es la forma de honrar la memoria de sus seres queridos.

Saito lucha contra Usui y ordena a Kenshin y a Sanosuke que se marchen hacia el siguiente nivel llevándose a Yumi.

Aoshi está decidido a acabar con Kanshin y demostrar que es el más fuerte.

Mienstras Kenshin lucha con Aoshi tratará de consegir que este vuelva a ser un buen hombre.

Kaoru y Misao luchan encarnizadamente contra tres miembros de las "diez espadas"

Fuji y Saitsuchi aprovechan que todos están exhaustos y se preparan para destruir. Yahiko se recupera y les pide a los demás que no se rindan, pues su creencia en Kenshin lo impulsa a seguir luchando.

Kenshin descubre que no puede predecir los movimientos de Soujiro pues él no muestra emociones.

Soujiro encontro a Shishio herido, le dio vendas y alimento. Shishio le inculca su ideal de "el más fuerte sobrevive".

Kenshin y Soujiro enfrentan sus mejores técnicas y Kenshin logra ganar con su Amakakeru Ryū no Hirameki. Él y Sanosuke siguen hasta la última habitación, donde se encuentra Shishio.

Yumi ha llevado a Kenshin y Sanosuke hasta la Sala del Fuego, la cual está en la azotea después de cruzar un puente. Allí se encuentran Shishio y su administrador

Kenshin no puede emplear su Amakakeru Ryū no Hirameki pues el secreto ha sido revelado. Shishio lo ataca con la pólvora de sus guantes y causa una pequeña explosión que deja inconsciente a Kenshin.

Aoshi lucha contra Shishio porque siente que hizo perder tiempo y energías a Kenshin y que le dará tiempo para regresar.

Mientras Yumi está rogando a Kenshin que no ataque a Shishio, éste le atraviesa su espada y a la vez logra herir a Kenshin.

Todos se recuperan favorablemente de las heridas infligidas durante la batalla.

Kaoru siente que todos han permanecido en Kioto lo suficiente por lo que deciden regresar a Tokio. Antes de ello, cada uno toma rumbos diferentes como una despedida

Kaoru, Sanosuke y Yahiko se quedan en el dōjō reparando y limpiando; mientras que Kenshin, a petición de Kaoru, se dirige a pescar ya que no tienen nada que cenar. Él va al río con Ayame y Suzume y no está teniendo mucha suerte con la pesca, en eso ve a un pescador que parece muy experimentado. Unos rufianes atacan a una persona y el pescador la defiende, pero Kenshin nota una habilidad especial en él. Las niñas se acercan y así el pescador le cuenta a Kenshin su historia: Su nombre es Rinosuke y era un estudiante de kendo.

Kenshin y Kaoru intervienen cuando unos bandidos asaltan a un príncipe extranjero. Cuando llevan al herido al dojo, descubren que este tiene un doble.

Un perro se escapa con la llave de una importante caja fuerte. Sanosuke se lleva al revoltoso animal al dojo sin saber que una peligrosa banda lo persigue.

Se acerca la tradicional noche de Tanabata. En plena tarde, Kaoru, Otae y Tsubame están de paseo hasta que hacen parada en una joyería donde observan con asombro un valioso anillo. Kaoru se ilusiona tanto con el deseo de que Kenshin sea quien le regale tan preciado detalle y le proponga matrimonio, que termina desmayándose de la impresión.

Misao encuentra que han grabado una marca en un cadáver idéntica a una nota recibida por Aoshi.

Okina vincula el asesinato de un político con la persecución sufrida por los cristianos en la era de la dinastía Edo.

Kenshin y sus amigos encuentran a un embajador al que Kenshin rescató.

Kenshin es atacado por un desconocido que cree que es un demonio.

Kaioh confabula para derrocar el gobierno Meiji.

Shougo intenta curar a su hermana pero no lo consigue pese a sus conocimientos médicos.

Kenshin y sus amigos tratan de escapar de una cueva en la que están encerrados por culpa de un desprendimiento.

A menos que Kenshin pueda impedirlo el ejército se enfrentará a Shougo.

Kenshin tratará de negociar la paz y salvar a Misao que ha sido atrapada.

Sanosuke le da a Kaoru una carta para Shougo el cual se ha rendido poniendo fin a la guerra.

Kenshin y compañía tratan de salvar a un hombre que afirma ser Battousai.

Un pintor se enamora de Kaoru cuando el grupo trabaja en un restaurante para pagar una cuenta.

Yahiko protege a un hombre de un grupo de atacantes que se rien de él.

Cuando Itsuko sale a hacer un recado, la secuestran. Kenshin se enfrentará a un grupo de asesinos.

Kenshin les pide a todos los del dojo que colaboren para rescatar a Itsuko.

Kenshin se enfrentará contra el líder del Beni Aoi y también contra Tetsuma.

Los Caballeros Negros van tras la medicina milagrosa y les pisan los talones al grupo.

Los Caballeros Negros planean usar la medicina milagrosa para dominar el mundo.

El grupo recorre una senda plagada de obstáculos en busca de la medicina milagrosa, los ninjas aguardan su momento.

El grupo de Kenshin intentará sobrevivir a los peligros que les esperan.

La lucha contra los caballeros negros es inminente.

Kenshin y Meldars se enfrentan en una batalla por por la medicina milagrosa.

Las chicas se encuentran con un carterista cuando salen de compras, tendrán que combatir contra su banda.

La magia del Feng Shui rodea un santuario y provoca varios desastres en Tokio.

Jinpu les cuenta a Kenshin y sus amigos lo que sabe sobre los dos clanes del Feng Shui y el dojo es atacado

Kaoru es gravemente herida y Jinpu organizará una expedición para buscar aguas curativas.

Reisui se propone detener a Kenshin y Jinpu que parten en busca de la cresta de jade.

Jinpu descubre una forma de ser un héroe cuando él, Kenshin y Sanosuke se enfrentan al clan del agua.