En el año 1999 , una extranjera abandonada fortaleza de batalla aterriza en el planeta Tierra . Nuestros científicos e ingenieros más brillantes pasan los próximos diez años la reconstrucción de la nave dañada , y el estudio de su tecnología altamente avanzada , conocida como Robotech ! Una raza de guerreros del espacio profundo , los Zentraedi , introduzca la escena , empeñado en recuperar la nave perdida y destruir la civilización de la Tierra . Una batalla por la supervivencia de nuestro planeta está en , y el joven Rick Hunter se ve envuelto en la guerra , pilotar un avión de combate no familiar , con ingeniería sofisticada que no puede empezar a entender !

Los alienígenas atacan con toda su fuerza , y la desesperada batalla por el planeta Tierra , alcanza las mismas calles de Ciudad Macross . Coraje humano y habilidad se ponen a prueba hasta el límite, en contra de las armas superiores de los Zentraedi . Un intento de rescate heroico ( por Rick Hunter , para salvar a Lynn Minmei ) se convierte en una experiencia de pesadilla .

Los invasores Zentraedi siguen cerrando , y la batalla por el planeta Tierra se vuelve aún más intensa . El intento de escapar de las fuerzas alienígenas superiores , Rick y Minmei quedan varadas en el espacio, al tratar de reunirse con sus congéneres . Capitán Gloval toma una decisión desesperada para ejecutar un salto al hiperespacio , lo que puede llevar a su barco a un lugar seguro , o lo que podría significar el fin para todos!

Rick y Minmei se dan cuenta que terminaron en una sección cerrada y olvidada del SDF-1. Por mucho que lo intenten, no pueden encontrar ninguna salida, ¡y nadie a bordo de la nave tiene idea de donde están!. El tiempo pasa lenta y cruelmente para la pareja encarcelada, ya que lo que comenzó siendo una aventura divertida, se convierte en una pesadilla mortal de hambre y agotamiento, conduciéndolos al borde de la histeria.

Los habitantes de la isla Macross tratan de normalizar sus vidas a bordo de la inmensa nave. El drama humano diario sucede teniendo la guerra interplanetaria como fondo, las fuerzas Zentraedi siguen tras la SDF-1 y continúan con la guerra iniciada en la Tierra. El Capitán Gloval deberá tomar una decisión de vida o muerte que determinará el destino de casi 70.000 refugiados.