После крушения спутника всё население небольшого городка вымирает из-за смертельной чумы, за исключением одного мужчины и одного младенца. Команда специалистов активируется и получает задание найти лекарство от того, что называется «Штамм Андромеда». Армия пытается дискредитировать и заставить замолчать наркозависимого репортера, который обнаруживает, что происходит что-то опасное.

Пока команда учёных лихорадочно ищет лекарство, журналист-расследователь Джек Нэш буквально попадает под обстрел. Президенту приходится принимать трудное решение, и чтобы предотвратить ядерную катастрофу, которая фактически усилит «штамм Андромеда», команде приходится преодолевать защитные системы здания, направленные на предотвращение заражения.