A mitad de las vacaciones de verano, 36 estudiantes, algunos con superpoderes recién descubiertos, se encuentran solos en su escuela secundaria, a la deriva en un vacío negro, incapaces de contactar con el mundo exterior. Algunos estudiantes intentan imponer orden, pero se enfrentan a la oposición.

Los estudiantes se trasladaron a una isla cercana, donde no tienen escasez de alimentos y pueden obtener lo que quieran a través del poder de Mizuho. De repente, comienzan a estallar incendios inexplicables y emprenden una búsqueda para descubrir quién o qué los está causando.

Nagara, Nozomi, Asakaze y Rajdhani continúan buscando nuevos mundos. Los estudiantes comienzan a desaparecer y sus cuerpos se encuentran "congelados" en conchas negras, por lo que Pony le pide a Mizuho que investigue el asunto. Mizuho le revela a Nagara una sorpresa sobre su poder.

Mientras los náufragos nadan en un misterioso sumidero, parecen ser llevados momentáneamente a casa. Cap invita a Nagara a jugar béisbol con él, lo que lo lleva a contar sobre la Liga de los Monos y cómo su lanzador estrella, Azul, perdió un juego perfecto.

Nagara y sus amigos usan su poder para explorar nuevos Mundos en un esfuerzo por regresar a casa. Mientras tanto, los otros estudiantes discuten con la Srta. Aki sobre que algunos estudiantes pudieron usar sus poderes de antemano, y eso puede ser lo que los dejó a la deriva.

Nagara y Rajdhani llegan a un Mundo llamado "El Cineasta" y descubren una película filmada en su totalidad desde el punto de vista de Nagara. Mizuho encuentra a un perro callejero llamado Yamabiko, que dice ser otro náufrago que asistió a la misma escuela que los otros estudiantes.

Habiendo aprendido la verdad sobre este Mundo, los grupos dirigidos por la Srta. Aki y Hoshi se preparan para irse por caminos separados. Nagara se encuentra en un Mundo al revés del que no puede salir libremente y se ve obligado a trabajar en la construcción de una Torre de Babel que se extiende hacia abajo.

Mientras viaja por el desierto, Mizuho le pregunta a Yamabiko cómo se convirtió en un perro. Yamabiko relata cómo, hace 5,000 años, vagó por diferentes mundos solo, hasta que conoció a una chica a la que poco a poco le abrió su corazón. Pero su felicidad duró poco.

En un gran baldío helado, los gemelos Sou y Seiji se han estado peleando durante milenios. La Srta. Aki dice que para cambiar al mundo, necesitan el poder "Inverso" de los gemelos, y Nagara y Mizuho vienen a ayudar. Yamabiko interroga a Sakura, uno de los gatos de Mizuho.